@article{Roslim_Nuryani_Herman_2018, title={Sekuen Penyandi 18S Ribosomal RNA dan Ubiquitin pada Pandanus sp. Asal Riau (Sequences Encoding 18S Ribosomal RNA and Ubiquitin on Pandanus sp. from Riau)}, volume={8}, url={https://ejournal.unsrat.ac.id/v3/index.php/bioslogos/article/view/20590}, DOI={10.35799/jbl.8.1.2018.20590}, abstractNote={<p align="center"><strong><em>Abstrak</em></strong></p><p> </p><p><em>G</em><em>en penyandi 18S ribosomal RNA</em><em> (18S rRNA)</em><em> </em><em>dan ubiquitin merupakan anggota dari housekeeping genes yang sering digunakan sebagai kontrol internal pada analisis ekspresi.  Penelitian bertujuan mengisolasi </em><em>kedua gen tersebut </em><em>pada tanaman </em>Pandanus <em>sp asal Riau.  Metode penelitian meliputi isolasi DNA total, elektroforesis, PCR, purifikasi gel</em><em>,</em><em> se</em><em>k</em><em>uensing</em><em>, dan analisis data </em><em>sekuen DNA menggunakan program BioEdit version 7.0.0, BLASTn, dan MEGA6.  Sekuen DNA penyandi 18S rRNA</em><em> (</em><em>420 bp</em><em>)</em><em> dan ubiquitin (493 bp</em><em>)</em><em> </em><em>telah diperoleh.  </em><em>S</em><em>ekuen 18S rRNA Pandanus sp memiliki kemiripan sebesar 99% dengan beberapa spesies </em>Pandanus<em>. </em><em>S</em><em>ekuen ubiquitin Pandanus sp memiliki kemiripan sebesar 87%-89% dengan sekuen ubiquitin dari beberapa tanaman dan alga hijau.  Dendrogram yang diturunkan dari kedua sekuen juga mendukung hasil tersebut bahwa sekuen 18S rRNA</em><em> </em><em>dari </em>Pandanus<em> sp. membentuk satu kelompok dengan </em><em>sesama </em><em>sekuen 18S rRNA, begitu pula dengan sekuen ubiquitin </em>Pandanus<em> sp. membentuk satu kelompok dengan </em><em>sesama </em><em>sekuen ubiquitin. Kedua gen berpotensi </em><em>dijadikan </em><em>kontrol internal </em><em>setelah dilakukan validasi</em><em>.</em></p><p><em>Kata kunci: RNA ribosom 18S, h</em><em>ousekeeping gene</em>, Pandanus <em>sp.,</em> <em>Riau, ubiquitin</em><em>.</em><em></em></p><p> </p><p align="center"><strong><em>Abstrak</em></strong></p><p> </p><p><em>This research aimed to isolate genes encodi</em><em>n</em><em>g </em><em>18S </em><em>rRNA</em><em> an</em><em>d</em><em> </em><em>ubiquitin</em><em> in</em><em> </em>Pandanus<em> sp. </em><em>from</em><em> Riau.</em><em> </em><em>The research </em><em>method included total DNA extraction, polymerase chain reaction, electrophoresis, gel purification, sequencing, and DNA sequence analysis using </em><em>BioEdit version 7.0.0, BLASTn, an</em><em>d</em><em> MEGA6</em><em> programs</em><em>.</em><em> Sequences encoding </em><em>18S </em><em>rRNA</em><em> </em><em>(</em><em>420 bp</em><em>)</em><em> an</em><em>d</em><em> ubiquitin</em><em> (</em><em>493 bp</em><em>) had been obtained</em><em>.</em><em> The BLASTn analysis showed that </em><em>18S rRNA </em><em>of </em>Pandanus<em> sp.</em><em> had </em><em>99% </em><em>similarity to some sp</em><em>ecies</em><em> of</em><em> </em>Pandanus<em>.</em><em> </em><em>Ubiquitin</em><em> sequence in</em><em> </em>Pandanus<em> sp.</em><em> had </em><em>87%-89%</em><em> similarity to </em><em>ubiquitin</em><em> sequences of some plants and green algae</em><em>.  Dendrogram</em><em>s generated from both sequences also supported </em><em>the results </em><em>that </em><em>18S rRNA</em><em> sequence of</em><em> Pandanus sp.</em><em> </em><em>was the same </em><em>group </em><em>as 18S rRNA</em><em> on</em><em> Pandanus</em><em> genus. Similarly</em><em>,</em><em> ubiquitin sequence of </em>Pandanus<em> sp</em><em> </em><em>was the same </em><em>cluster </em><em>as </em><em>other plants. Both genes were potentially used as internal control in gene expression studies after </em><em>their </em><em>validation</em><em>.</em></p><p><em>Keywords: 18S ribosomal RNA,</em><em> housekeeping gene,</em><em> </em>Pandanus<em> sp., Riau, ubiquitin</em><em>.</em></p>}, number={1}, journal={JURNAL BIOS LOGOS}, author={Roslim, Dewi Indriyani and Nuryani, Nurin and Herman, Herman}, year={2018}, month={Jul.} }