ANALISIS SEKUENS DAN FILOGENETIK BEBERAPA TUMBUHAN Syzygium (MYRTACEAE) DI SULAWESI UTARA BERDASARKAN GEN matK

Authors

  • Presticilla D Irawan Universitas Sam Ratulangi
  • Trina E Tallei Universitas Sam Ratulangi
  • Beivy J Kolondam Universitas Sam Ratulangi

DOI:

https://doi.org/10.35799/jis.16.2.2016.14022

Abstract

Syzygium (Myrtaceae) merupakan tumbuhan yang memiliki banyak manfaat di bidang ekonomi dan kesehatan. Informasi dan publikasi mengenai klasifikasi tumbuhan Syzygium masih sedikit. Pengelompokkan beberapa jenis tumbuhan dalam genus ini masih ditemui masalah, antara lain tumpang tindihnya nama Syzygium dengan Eugenia dan beberapa tumbuhan belum diketahui posisinya dalam klasifikasi. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis variasi sekuens gen matK dan mengkonstruksi pohon filogenetik pada beberapa tumbuhan Syzygium di Sulawesi Utara, yaitu pakoba, jamblang dan bombongan. Analisis variasi sekuens menunjukkan adanya perbedaan satu nukleotida antara tumbuhan pakoba dan jamblang, serta perbedaan 5-6 nukleotida antara bombongan dengan jamblang dan pakoba. Selain itu, variasi juga ditunjukan antara sekuens sampel tumbuhan Syzygium dengan sekuens kerabat yang diperoleh dari basis data GenBank yaitu adanya perbedaan 2-3 nukleotida dengan spesies kerabat terdekat dan perbedaan 5-6 nukleotida dengan spesies kerabat terjauh. Hasil perhitungan jarak genetik menggunakan Kimura-2-parameter menunjukkan nilai jarak interspesies kecil, yaitu 0.000-0.011.

Kata Kunci: Variasi Genetik, Gen matK, Syzygium, Sulawesi Utara.

Author Biographies

Presticilla D Irawan, Universitas Sam Ratulangi

Program Studi Biologi FMIPA UNSRAT

Jl. Kampus Unsrat, Manado 95115

Trina E Tallei, Universitas Sam Ratulangi

Program Studi Biologi FMIPA UNSRAT

Jl. Kampus Unsrat, Manado 95115

Beivy J Kolondam, Universitas Sam Ratulangi

Program Studi Biologi FMIPA UNSRAT

Jl. Kampus Unsrat, Manado 95115

Downloads

Published

2016-10-10

How to Cite

Irawan, P. D., Tallei, T. E., & Kolondam, B. J. (2016). ANALISIS SEKUENS DAN FILOGENETIK BEBERAPA TUMBUHAN Syzygium (MYRTACEAE) DI SULAWESI UTARA BERDASARKAN GEN matK. Jurnal Ilmiah Sains, 16(2), 43–50. https://doi.org/10.35799/jis.16.2.2016.14022

Issue

Section

Articles