Endomorphism Representation Matrix From Standard Genetic Code

Authors

  • Isah Aisah Department of Mathematics, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Padjadjaran University, Bandung
  • B. Subartini Department of Mathematics, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Padjadjaran University, Bandung
  • A. Muhaemin Department of Mathematics, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Padjadjaran University, Bandung

DOI:

https://doi.org/10.35799/jis.20.1.2020.27787

Abstract

Mutations are changes in genetic material that can occur at the level of genes or chromosomes. Mutations at the gene level are structural changes in the genetic code. In this paper we will investigate the necessary and sufficient conditions for an endomorphism called autumorphism.  The method used in this research paper is a review of literature conducted by collecting literature from previous studies in accordance with the study discussed.  Mathematically, genetic mutations can be viewed with an endomorphism and automorphism  f in the vector space which maps the standard genetic code sequence of wild-type genes into mutant genes. In the endomorphism there is a matrix called the endomorphism representation matrix.

Keywords: authomorphism, endomophism, mutation

 

Matriks Representasi Endomorfisma Dari Kode Genetik Standar

ABSTRAK

Mutasi merupakan perubahan pada materi genetik yang dapat terjadi pada tingkat gen maupun kromosom.  Mutasi pada tingkat gen merupakan perubahan struktur dalam kode genetik. Pada penelitian ini akan dibahas syarat perlu dan syarat cukup sebuah endomorfisma disebut automorfisma. Metode yang digunakan dalam makalah penelitian ini adalah tinjauan literatur yang dilakukan dengan mengumpulkan literatur dari penelitian-penelitian sebelumnya sesuai dengan penelitian yang dibahas. Secara matematis, mutasi genetik dapat ditinjau dengan sebuah endomorfisma dan automorfisma  pada ruang vektor  yang memetakan barisan kode genetik standar gen wild-type ke dalam gen mutan. Pada endomorfisma tersebut terdapat sebuah matriks yang disebut matriks representasi endomorfisma.

Kata kunci: Automorfisma, endomorfisma, mutasi Genetik

Mutations are changes in genetic material that can occur at the level of genes or chromosomes. Mutations at the gene level are structural changes in the genetic code. In this paper we will investigate the necessary and sufficient conditions for an endomorphism called autumorphism.  The method used in this research paper is a review of literature conducted by collecting literature from previous studies in accordance with the study discussed.  Mathematically, genetic mutations can be viewed with an endomorphism and automorphism  f in the vector space which maps the standard genetic code sequence of wild-type genes into mutant genes. In the endomorphism there is a matrix called the endomorphism representation matrix.

Keywords: authomorphism, endomophism, mutation

 

Matriks Representasi Endomorfisma Dari Kode Genetik Standar

ABSTRAK

Mutasi merupakan perubahan pada materi genetik yang dapat terjadi pada tingkat gen maupun kromosom.  Mutasi pada tingkat gen merupakan perubahan struktur dalam kode genetik. Pada penelitian ini akan dibahas syarat perlu dan syarat cukup sebuah endomorfisma disebut automorfisma. Metode yang digunakan dalam makalah penelitian ini adalah tinjauan literatur yang dilakukan dengan mengumpulkan literatur dari penelitian-penelitian sebelumnya sesuai dengan penelitian yang dibahas. Secara matematis, mutasi genetik dapat ditinjau dengan sebuah endomorfisma dan automorfisma  pada ruang vektor  yang memetakan barisan kode genetik standar gen wild-type ke dalam gen mutan. Pada endomorfisma tersebut terdapat sebuah matriks yang disebut matriks representasi endomorfisma.

Kata kunci: Automorfisma, endomorfisma, mutasi Genetik

References

Akhtar, J., T. Ali & N. Gohain. 2015. Graph in Genetic Code Algebra. Bioinformatics and Intelligent Control, 4: 1-4.

Dummit, D.S., & R.M. Foote. 2004 AbstractAlgebra, 3^rd ed. John Wiley &Sons, New York.

Fraleigh, J.B. 2003. A First Course in Abstract Algebra, 7^th ed. Pearson Education, Illinois.

Gallian, J.A. 2010. Contemporary Abstract Algebra. Richard Stratton, Belmont.

Heirstein, I.N. 1996. Abstract Algebra. Prentice-Hall, New Jersey.

Jose, M.V., et al. 2006. An Extended RNA code and its Relationship to The Standard Genetic Code: An Algebraic and Geometrical Approach. Bull. Math. Biol, 69: 215-243.

Shánchez, R., E. Morgado & R. Grau. 2004. The Genetic Code Boolean Lattice. MATCH Commun. Math. Comput. Chem, 52: 29-45.

Shánchez, R., E. Morgado & R. Grau. 2005. Gen Algebra from a Genetic Code Algebraic Structure. J. Math. Biol., 51(4): 431-457.

Szekeres, P. 2004. A Course in Modern Mathematical Physics. Cambridge University Press, New York.

Downloads

Additional Files

Published

2020-04-20

How to Cite

Aisah, I., Subartini, B., & Muhaemin, A. (2020). Endomorphism Representation Matrix From Standard Genetic Code. Jurnal Ilmiah Sains, 20(1), 26–30. https://doi.org/10.35799/jis.20.1.2020.27787

Issue

Section

Articles